Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A4

Vsig8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig8Q6P3A4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vsig8Q6P3A4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vsig8Q6P3A4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms