Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PrimpolQ6P1E7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PrimpolQ6P1E7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrimpolQ6P1E7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms