Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc189Q6NZQ0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc189Q6NZQ0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc189Q6NZQ0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms