Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms