Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt40Q6IFX3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt40Q6IFX3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt40Q6IFX3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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