Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edrf1Q6GQV7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Edrf1Q6GQV7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Edrf1Q6GQV7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Edrf1Q6GQV7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Edrf1Q6GQV7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Edrf1Q6GQV7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Edrf1Q6GQV7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Edrf1Q6GQV7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Edrf1Q6GQV7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Edrf1Q6GQV7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Edrf1Q6GQV7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms