Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atg9bQ6EBV9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atg9bQ6EBV9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms