Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Jmjd1cQ69ZK6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Jmjd1cQ69ZK6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms