Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrcc1Q69ZB0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrcc1Q69ZB0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrcc1Q69ZB0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrcc1Q69ZB0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrcc1Q69ZB0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrcc1Q69ZB0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrcc1Q69ZB0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrcc1Q69ZB0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrcc1Q69ZB0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrcc1Q69ZB0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrcc1Q69ZB0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrcc1Q69ZB0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrcc1Q69ZB0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lrrcc1Q69ZB0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrcc1Q69ZB0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrcc1Q69ZB0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrcc1Q69ZB0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrcc1Q69ZB0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrcc1Q69ZB0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 375.9 ms