Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Surf4Q64310 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Surf4Q64310 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf4Q64310 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms