Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Zfp248Q640N4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Zfp248Q640N4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Zfp248Q640N4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Zfp248Q640N4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Zfp248Q640N4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Zfp248Q640N4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp248Q640N4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Zfp248Q640N4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Zfp248Q640N4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Zfp248Q640N4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Zfp248Q640N4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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