Protein–RNA interactions for Protein: Q640L3

Ccpg1, Cell cycle progression protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccpg1Q640L3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccpg1Q640L3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccpg1Q640L3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccpg1Q640L3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccpg1Q640L3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccpg1Q640L3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccpg1Q640L3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccpg1Q640L3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccpg1Q640L3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccpg1Q640L3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccpg1Q640L3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccpg1Q640L3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccpg1Q640L3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccpg1Q640L3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccpg1Q640L3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccpg1Q640L3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccpg1Q640L3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms