Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nptx1Q62443 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nptx1Q62443 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nptx1Q62443 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms