Protein–RNA interactions for Protein: Q62432

Smad2, Mothers against decapentaplegic homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad2Q62432 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smad2Q62432 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smad2Q62432 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms