Protein–RNA interactions for Protein: Q62384

Zpr1, Zinc finger protein ZPR1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zpr1Q62384 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zpr1Q62384 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Zpr1Q62384 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Zpr1Q62384 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zpr1Q62384 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zpr1Q62384 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zpr1Q62384 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Zpr1Q62384 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zpr1Q62384 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zpr1Q62384 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zpr1Q62384 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zpr1Q62384 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zpr1Q62384 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zpr1Q62384 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zpr1Q62384 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zpr1Q62384 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zpr1Q62384 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms