Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Taf6Q62311 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf6Q62311 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms