Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbm38Q62176 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbm38Q62176 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbm38Q62176 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rbm38Q62176 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbm38Q62176 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbm38Q62176 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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