Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Prm3Q62100 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prm3Q62100 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Prm3Q62100 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prm3Q62100 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Prm3Q62100 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Prm3Q62100 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prm3Q62100 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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Prm3Q62100 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Prm3Q62100 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
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