Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Npm1Q61937 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Npm1Q61937 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Npm1Q61937 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Npm1Q61937 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Npm1Q61937 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Npm1Q61937 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Npm1Q61937 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Npm1Q61937 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Npm1Q61937 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Npm1Q61937 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Npm1Q61937 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Npm1Q61937 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Npm1Q61937 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Npm1Q61937 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Npm1Q61937 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Npm1Q61937 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Npm1Q61937 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Npm1Q61937 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Npm1Q61937 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Npm1Q61937 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Npm1Q61937 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Npm1Q61937 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Npm1Q61937 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Npm1Q61937 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Npm1Q61937 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Npm1Q61937 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Npm1Q61937 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Npm1Q61937 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Npm1Q61937 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Npm1Q61937 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Npm1Q61937 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Npm1Q61937 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Npm1Q61937 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Npm1Q61937 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Npm1Q61937 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Npm1Q61937 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Npm1Q61937 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms