Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itga6Q61739 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itga6Q61739 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Itga6Q61739 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms