Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EsrrbQ61539 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EsrrbQ61539 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms