Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TmpoQ61033 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TmpoQ61033 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TmpoQ61033 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms