Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klf3Q60980 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Klf3Q60980 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klf3Q60980 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms