Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atf3Q60765 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Atf3Q60765 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atf3Q60765 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms