Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Epha1Q60750 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Epha1Q60750 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Epha1Q60750 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Epha1Q60750 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Epha1Q60750 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Epha1Q60750 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Epha1Q60750 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Epha1Q60750 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Epha1Q60750 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Epha1Q60750 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Epha1Q60750 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Epha1Q60750 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha1Q60750 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha1Q60750 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha1Q60750 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha1Q60750 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha1Q60750 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha1Q60750 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha1Q60750 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha1Q60750 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha1Q60750 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha1Q60750 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha1Q60750 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha1Q60750 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha1Q60750 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha1Q60750 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epha1Q60750 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Epha1Q60750 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epha1Q60750 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epha1Q60750 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms