Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SkiQ60698 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SkiQ60698 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SkiQ60698 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SkiQ60698 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SkiQ60698 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SkiQ60698 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SkiQ60698 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SkiQ60698 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SkiQ60698 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SkiQ60698 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms