Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Foxd4Q60688 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Foxd4Q60688 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms