Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf123Q5XPI3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf123Q5XPI3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rnf123Q5XPI3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms