Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF90

Atp13a4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a4Q5XF90 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a4Q5XF90 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a4Q5XF90 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp13a4Q5XF90 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms