Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tnfsf15Q5UBV8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf15Q5UBV8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms