Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT6

Zkscan4, MCG23028, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan4Q5SZT6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zkscan4Q5SZT6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zkscan4Q5SZT6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zkscan4Q5SZT6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zkscan4Q5SZT6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zkscan4Q5SZT6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zkscan4Q5SZT6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan4Q5SZT6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms