Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim38Q5SZ99 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim38Q5SZ99 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim38Q5SZ99 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim38Q5SZ99 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim38Q5SZ99 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim38Q5SZ99 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim38Q5SZ99 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim38Q5SZ99 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Trim38Q5SZ99 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim38Q5SZ99 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Trim38Q5SZ99 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim38Q5SZ99 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim38Q5SZ99 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim38Q5SZ99 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Trim38Q5SZ99 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Trim38Q5SZ99 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim38Q5SZ99 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim38Q5SZ99 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim38Q5SZ99 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim38Q5SZ99 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim38Q5SZ99 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim38Q5SZ99 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim38Q5SZ99 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Trim38Q5SZ99 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim38Q5SZ99 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim38Q5SZ99 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim38Q5SZ99 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim38Q5SZ99 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim38Q5SZ99 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim38Q5SZ99 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim38Q5SZ99 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim38Q5SZ99 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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