Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc42Q5SV66 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc42Q5SV66 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc42Q5SV66 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms