Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctc1Q5SUQ9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctc1Q5SUQ9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctc1Q5SUQ9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms