Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ankrd40Q5SUE8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd40Q5SUE8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms