Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Utp18Q5SSI6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Utp18Q5SSI6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms