Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc88aQ5SNZ0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms