Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scarf1Q5ND28 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scarf1Q5ND28 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scarf1Q5ND28 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms