Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Trim41Q5NCC3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Trim41Q5NCC3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Trim41Q5NCC3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms