Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC97

Vmn1r209, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r209Q5NC97 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r209Q5NC97 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r209Q5NC97 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r209Q5NC97 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r209Q5NC97 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r209Q5NC97 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r209Q5NC97 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn1r209Q5NC97 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r209Q5NC97 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms