Protein–RNA interactions for Protein: Q5F201

Cfap52, Cilia- and flagella-associated protein 52, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap52Q5F201 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap52Q5F201 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap52Q5F201 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap52Q5F201 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap52Q5F201 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap52Q5F201 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap52Q5F201 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap52Q5F201 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap52Q5F201 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cfap52Q5F201 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfap52Q5F201 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfap52Q5F201 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfap52Q5F201 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfap52Q5F201 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfap52Q5F201 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfap52Q5F201 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cfap52Q5F201 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cfap52Q5F201 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cfap52Q5F201 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms