Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Srrm1Q52KI8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srrm1Q52KI8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srrm1Q52KI8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms