Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdp2Q504M2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdp2Q504M2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms