Protein–RNA interactions for Protein: Q497M3

Apobec4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec4Q497M3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec4Q497M3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec4Q497M3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec4Q497M3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec4Q497M3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec4Q497M3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec4Q497M3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec4Q497M3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec4Q497M3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec4Q497M3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec4Q497M3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec4Q497M3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec4Q497M3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec4Q497M3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec4Q497M3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec4Q497M3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec4Q497M3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec4Q497M3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec4Q497M3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec4Q497M3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec4Q497M3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms