Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx25Q3ZT31 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Snx25Q3ZT31 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms