Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd5Q3V1H9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd5Q3V1H9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd5Q3V1H9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms