Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim9Q3V0X1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim9Q3V0X1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim9Q3V0X1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim9Q3V0X1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim9Q3V0X1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim9Q3V0X1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Smim9Q3V0X1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Smim9Q3V0X1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Smim9Q3V0X1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Smim9Q3V0X1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim9Q3V0X1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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