Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp48Q3V0C5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp48Q3V0C5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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