Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc55Q3UY51 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms