Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chpf2Q3UU43 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chpf2Q3UU43 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Chpf2Q3UU43 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Chpf2Q3UU43 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms